什么是支原體核酸法
支原體核酸法包括PCR和qPCR,通過檢測支原體的特異核酸序列,以確定細胞上清或生物制品中是否存在支原體污染的一種方法。
由于支原體核酸法具有檢測時間短(只需3-4h)、操作便捷等特點,越來越受到生物制品企業(yè)的青睞。
支原體核酸法可作為藥典規(guī)定的培養(yǎng)法或DNA染色法的替代方法,或與以上方法相互補充。
事實上,早在2011年,就有動物疫苗廠家在2011年第5期的《廣東農(nóng)業(yè)科學》上,報道了用德國Minerva Biolabs(簡稱MB)公司的支原體PCR試劑盒,用于檢測疫苗中是否存在支原體的污染,它可與培養(yǎng)法互為補充,共同用于生產(chǎn),為生產(chǎn)提供可靠的數(shù)據(jù)支持。
支原體標準品
方法驗證
支原體核酸法在用于放行檢測之前,需先進行方法驗證。歐洲藥典和日本藥典均要求核酸法需要在靈敏度、特異性和耐用性三個指標方面達到要求。
在靈敏度方面(又稱最di檢測限),要求核酸法替代培養(yǎng)法,則靈敏度需達到10CFU/ml;核酸法替代DNA染色法,則靈敏度需達到100CFU/ml。
在特異性方面,歐洲藥典和日本藥典要求,核酸法要識別的常見9種支原體,而不識別與支原體有近緣關(guān)系的菌屬,如丙酮丁醇梭菌、嗜酸乳桿菌和肺炎鏈球菌,也不識別其他細菌和哺乳動物DNA。
在耐用性方面,歐洲藥典要求檢測結(jié)果不受方法參數(shù)的小的偏差的影響,如濃度的變化(MgCl2、引物、dNTP)、提取步驟的細微差別等。實際上這是強調(diào)結(jié)果的可靠性和穩(wěn)定性,不受人為操作誤差的影響。這可通過3輪不同時間段內(nèi)的檢測來實現(xiàn),每輪進行8次重復(fù)檢測,最后觀察結(jié)果有什么變化。
在進行方法驗證時,參比標準品是bi不可少的。著名微生物防控專家德國MB公司提供有一系列的支原體標準品和支原體DNA標準品,用于支原體核酸法的方法學驗證。
支原體標準品
Minerva Biolabs標準品
MB提供的標準品有三類:
靈敏度標準品
同時也用于耐用性驗證。該標準品為凍干粉型的滅活支原體,這樣不會造成實驗室污染。原支原體來自英國NCTC菌種保藏中心,由于傳代次數(shù)低,也很少發(fā)生突變。支原體經(jīng)標準定量,有10CFU/管和100CFU/管可選。使用時用1ml與待測樣本同樣的基質(zhì)液去溶解。之后進行支原體DNA抽提,再進行核酸法檢測。如結(jié)果陽性,則表明最di檢測限能達到上述標準。
特異性驗證用標準品
它包括支原體基因組DNA以及細菌基因組DNA,種屬經(jīng)測序驗證。該標準品為10ng左右包裝,為凍干粉型。用于PCR和qPCR方法對支原體物種的特異性檢查,每種支原體DNA經(jīng)測序驗證,濃度經(jīng)滴度測定。
PCR定量標準品
該標準品是經(jīng)過嚴格定量的支原體DNA標準品,每管支原體基因組DNA的量為1×10^8基因組拷貝,用于10倍梯度稀釋制備標準曲線,以對核酸法(主要是qPCR)的檢測限進行精確定量,并可驗證標準品濃度對數(shù)與Ct值的線性關(guān)系。
值得指出的是,歐洲藥典和日本藥典均要求先進行支原體DNA抽提,再進行核酸法檢測。因此,方法驗證實際上包括了核酸法的這兩部分。
對于生物制品、細胞治療產(chǎn)品的生產(chǎn)企業(yè),在選用已經(jīng)過廠家全面驗證的支原體檢測試劑盒之外,還需自己按照待測樣本類型進行方法的適用性驗證。
試劑盒的驗證并不能代替包括操作過程在內(nèi)的方法的適用性,操作、樣本基質(zhì)和儀器同樣會對核酸法的技術(shù)指標產(chǎn)生不可忽視的影響。因此“對癥下藥”就顯得尤為重要了